Kur’an eğitim merkezlerinin hedefleri şunlardır:

a) Öğrencilerin Kur'an-ı Kerim'i okuma, temel dini bilgiler ve hafızlık ile ilgili bilgi ve becerilerini geliştirmek.

b) Temel düzeyde Arapça eğitimi vererek öğrencilerin Kur'an-ı Kerim’in ana konularına vâkıf olmalarını sağlamak.

c) İslami ilimler alanında Kur'an-ı Kerim ve sünnet temelli eğitim vermek.

ç) Kur'an-ı Kerim başta olmak üzere, İslami ilimlerle ilgili temel kaynakları ve güncel çalışmaları kullanabilme becerisi kazandırmak.

d) Öğrencilerin sosyal ve kültürel açıdan gelişimlerini sağlamak.

e) Öğrencilerin millî ve manevi bilince sahip, insanlara saygılı, öğrendiklerini teori ve pratik bütünlüğü içinde ahlakî yaşantılara dönüştürebilen bireyler olarak yetişmelerine katkı sağlamak.

f) Öğrencilerin katılımcı, araştırmacı, problem çözücü ve aidiyet bilincine sahip sorumluluk sahibi olarak yetişmelerine katkı sağlamak.

Kur’an eğitim merkezlerinin ilkeleri

Kur’an eğitim merkezlerinin ilkeleri şunlardır:

a) Eğitim hizmetlerini Başkanlığın vizyonu, misyonu ve stratejik amaçları doğrultusunda; etkinlik, verimlilik ve tutumluluk ilkelerine uygun olarak yürütmek.

b) Eğitim hizmetlerini, öğrencilerin ihtiyaçları ile eğitimin ilke ve tekniklerini dikkate alarak gerçekleştirmek.

c) Eğitimde teori ve pratiğe birlikte yer vermek.

ç) Eğitim hizmetlerinin yürütülmesinde Diyanet Akademisi, müftülükler ve ilahiyat fakülteleriyle iş birliği yapmak.